Rome, 1510. Sur fond de jalousies et de rivalités entre Michel-Ange, Raphaël et Bramante, Livio, secrétaire particulier du pape Jules II, devient un enjeu passionnel entre les trois hommes. Ami de Michel-Ange, il lui montre un manuscrit latin qu'il a découvert au temple de la Sibylle, dans lequel il est question de l'empereur Auguste, de sa vision d'une Vierge à l'enfant et d'un mystérieux oracle.
En 1535, l'érudit Guillaume Postel est envoyé par François Ier en mission à Constantinople auprès de Soliman le Magnifique. De ce voyage, il ramène un Evangile apocryphe de l'apôtre Jacques qu'il publiera en 1551. Commence alors une quête de manuscrits anciens révélant des aspects inconnus de la vie de Jésus qui le mènera à Venise, Vienne et Londres.
Rome et Jérusalem, 62-67 après J.-C. Trente ans après Ponce Pilate, Lucius Albinus est procurateur de la province de Judée. A la demande de son oncle, sénateur romain secrètement converti au christianisme, Albinus entreprend de déchiffrer le cryptogramme sacré qui sert de signe de ralliement aux premiers chrétiens persécutés par Néron : le carré Sator.
En 405, saint Jérôme vit depuis vingt ans à Bethléem, dans un monastère qu'il a fondé après son exil d'Italie. Le moine érudit, qui a traduit le Nouveau Testament du grec au latin pour le pape Damase, entame une correspondance fictive avec son ancien ami, Rufin d'Aquilée, pour débattre du bien-fondé de son travail. Un roman où l'auteur évoque la période chaotique de la fin de l'Empire chrétien.
